Inunio:Flow

Ключевые функции

• Авторизация пользователей по пред созданной учетной записи.
• Возможность добавлять и редактировать данные пациента/ов.
• Добавлять образцы с мета-информацией в существующие карточки пациентов.
• Осуществлять загрузку файлов с данными высокопроизводительного секвенирования в формате *fastq (*fq.gz, *fastq.gz).
• Проводить исследования (на текущий момент доступен только 
• Во вкладке исследования (на данном этапе разработки) можно выбрать необходимый тип исследования, указать образец/файлы к которым данное исследование будет применено и запустить анализ на облачном сервере
• После завершения вычислений, в карточке исследования доступны ссылки для скачивания полученных файлов и отчетов о проведении исследования, возможность открывать отчеты непосредственно в браузере
• Для файлов формата *bam (в доступной версии являются конечным результатом исследования) доступна возможность открывать их в веб версии геномного браузера IGV, не покидая интерфейса системы.

Текущие ограничения

• Возможен запуск анализа только для данных экзомного секвенирования человека.
• Для выравнивания используется hg38 версия референсного генома.
• Для оценки эффективности целевого обогащения используется bed-файл от панели Agilent SureSelectV7 (анализ данных экзомов, полученных с помощью других реагентов возможен, однако при вычислении эффективности целевого обогащения (fold enrichment) будет использованы геномные координаты указанной выше панели.

Документация

Стоимость: Предоставляется по запросу.

Описание функциональных характеристик InUnio Flow (pdf, 1.35MB)

Описание эксплуатации программного обеспечения InUnio Flow (pdf, 0.53MB)